Пріоритетні напрями наукової діяльності інституту сьогодні:

• вивчення специфіки взаємодії ономастикону державотворчої нації та ономастиконів національних меншин в незалежній Україні; 
• історія української мови, відродження імен українських мовознавців, заборонених тоталітарним режимом, еволюція стильових і жанрових різновидів української літературної мови;
• соціолінгвістичні параметри розвитку й функціонування української мови, зокрема міноритарна політика та дезінтеграційні загрози єдності україномовного простору;
• українська мова та культура в країнах Центральної Європи та Балканського півострова.

У кожному з цих напрямів Л. Белей має чималий доробок: комплексні монографії, словники, наукові та науково-публіцистичні статті, які отримали широке визнання як в Україні, так і за її межами. До найважливіших праць, які стали вислідом клопіткої науково-дослідної роботи, можна зарахувати:

Белей Л. Українські імена колись і тепер. Київ: Темпора, 2010. 128 c.

Белей Л. Ім’я дитини в українській родині. Харків: Фоліо, 2010. 285 с.

Белей, Л. О. Особові імена в українсько-словацькій міжмовній комунікації: укр.-словац. та словац.-укр. слов. особ. імен / М. Чіжмарова, Л. О. Белей. Ужгород: Ґражда, 2013.  92 с.

Белей Любомир. Не минаючи ані титли… Лінгвобіографія старослов’янської мови.  Київ: Темпора, 2015. 256 с.

Белей Л.О. «Русинський» сепаратизм: націєтворення in vitro. Київ: Темпора, 2017. 392 с.

Науково-дослідний інститут україністики ім. М. Мольнара під керівництвом Л. Белея у науковій серії «Ucrainica: аd fontеs» («Україністика: до джерел»), заснованій 2008 року, спільно з ужгородським приватним видавництвом «Ґражда» видали низку праць із приватної бібліотеки визначного словацького україніста Михайла Мольнара (4.11.1930 – 26.10. 2006). Українське історичне мовознавство збагатилося маловідомими або рідкісними в Україні студіями самого М. Мольнара, працями історика, державного та громадського діяча  Д. Дорошенка, славіста-мовознавця та історика української літератури Ю. Шевельова, письменника та літературного критикаЄ. Маланюка, публіциста А. Животка та ін. 

Книга творів Ю. Шевельова «Нарис сучасної української літературної мови та інші лінгвістичні студії (1947-1953), підготовлена в НДІ україністики імені М. Мольнара, стала переможцем Всеукраїнського рейтингу «Книга-2012» в номінації «Гуманітаристика».

Спільно з видавництвом «Темпора» підготовлено електронну версію раритетних україністичних видань із книгозбірні М. Мольнара – «Фонд Михайла Мольнара», з якими можна ознайомитися на сайті університетської бібліотеки. 

Значну роботу здійснили співробітники інституту при реалізації науково-дослідних робіт, опубліковано наукові праці, що відображають культуру українців західної діаспори та активні процеси у сфері українського ономастикону за умов незалежності  Української Держави:

Белей Любомир [Електронний ресурс]: до 60-річчя від дня народж.: біобібліогр. покажч. / Департамент культури, національностей та релігій Закарпат. облдержадмін.; КЗ «Закарпат. обл. універс. наук. б-ка ім. Ф. Потушняка» Закарпат. облради; уклад.: М.Б. Бадида, О.Д. Гаврош, І.В. Когутич-Гаврош; передм.: А. Вегеш, О. Лавер; ред. І.В. Когутич-Гаврош; відп. за вип. О.А. Канюка.  Ужгород, 2022.  112 с. 

Українське слово в гуманітарних дискурсах деіндустріальної епохи: Monografia zbiorowa / Redakcja Oleh Beley.  Siedlce: Wydawnictwo Naukowe. Instytut Kultury Regionalnej i Badań Literackich im. Franciszka Karpińskiego, 2020.  170 c. 

Белей О. Інноваційна сутність сучасного ономастикону української мови воєнного періоду. In memoriam: Любомир Белей (1962–2018). Збірник наукових праць. Ужгород: видавництво «Карпатська вежа», 2022. С. 63–83.

Сополига М. Українці Словаччини: матеріальні вияви народної культури та мистецтва/Передмова та переклад зі словацької мови Л. Белея. Київ: Темпора, 2011. 330 с.

Вегеш А.І. Традиції та новаторство української літературно-художньої антропонімії посттоталітарної доби. Ужгород, 2012. 270 с.

Гойдаш Ю., Гойдаш І. Чеська мова для українців. Навч. посібник. / Науковий редактор проф. Л.О. Белей. Ужгород: Карпатська Вежа, 2011. 230 с. (Державний вищий науковий заклад «Ужгородський національний університет; Науково-дослідний інститут україністики ім. М. Мольнара)

Вегеш А.І., Лавер О.В. Любомир Омелянович Белей. Календар краєзнавчих пам’ятних дат Закарпаття на 2022 рік. Ужгород: ТОВ «Рік-У», 2021. С. 101–110.

Лавер О. Любомир Омелянович Белей в історії українського мовознавства. In memoriam: Любомир Белей (1962–2018). Збірник наукових праць / За ред. Л. Белея. Ужгород: Видавництво «Карпатська вежа», 2022. С. 7–27.

Лавер О.В. Типи росіянізації: причини і наслідки. Парадигмавищої освіти в умовах війни та глобальних викликів XXІ століття : матеріали всеукраїнського науково-педагогічного підвищення кваліфікації, 18 липня – 28 серпня 2022 року. – Одеса : Видавничий дім «Гельветика», 2022.  С. 244–248.

Нуждак Л. Український ономастикон посттоталітарної доби у світлі еколінгвістики. Ужгород, 2012. 237 с.

       Негер О.Б. Українська урбанонімія Закарпаття у ХХ – на початку ХХІ століття. Ужгород: РІК-У, 2018. 200 с.

Романюк М. Соціально зумовлені інновації в ономастиконі Закарпаття кін. ХХ – поч. ХХІ ст. Ужгород, 2011. 122 с.

Чижмар О.М. Загальнонаціональне та регіональне в закарпатоукраїнській літературно-художній антропонімії ХІХ–ХХ століть: монографія. Ужгород: Видавництво «Карпатська Вежа», 2018. 180 с.

       Юрса Л.В. Історія бачвансько-сримського варіанта української літературної мови: [хрестоматія]. / ДВНЗ «Ужгородський національний університет», Науково-дослідний інститут україністики імені Михайла Мольнара [Відп. ред. Любомир Белей]. Львів: 2015. 175 с.

До науково-дослідної роботи та творчої діяльності в НДІ україністики залучено здобувачів вищої освіти, зокрема студентів Наукового гуртка україністів Вроцлавського університету під керівництвом О. Белея.

«У пошуках Атлантиди: українсько-угорське пограниччя очима славіста»: Науково-публіцистичний збірник україністики Вроцлавського університету, № 3. Ужгород – Вроцлав 2018 (НДІ Україністики ім. Михайла Мольнара та Науковий гурток україністів Вроцлавського університету). 76 с. 

«Українці Східної Словаччини: культура на межі...»: Науково-публіцистичний збірник україністики Вроцлавського університету, № 4. Ужгород – Вроцлав, 2019  (НДІ Україністики ім. Михайла Мольнара та Науковий гурток україністів Вроцлавського університету). 82 с. 

Співробітники інституту продовжують дослідження динамічних процесів у сфері українського онімного простору:

Белей Олег. Онімний ландшафт українського міста ХХІ століття: нарис проблематики. Ужгород – Вроцлав: НДІ україністики ім. М. Мольнара, 2021. 144 с. 

Вегеш А.І. Українська літературно-художня ономастика. Збірник статей. Ужгород: ТОВ «РІК-У», 2023. 510 с.

У руслі виконання зазначених пріоритетних завдань для здобувачів вищої освіти укладено нові посібники:

Белей О., Лавер О. Як справи? Українська мова у сферах підприємництва й адміністрування: навчальний посібник для іноземців. Ч.1. Ужгород: Видавництво «Інвазор», 2023. 90 с.

На пошану пам’яті професора Любомира Белея підготовлено збірник наукових статей. Видання містить стислий огляд наукової спадщини вченого, короткі спогади та наукові статті:

In memoriam: Любомир Белей (1962–2018). Збірник наукових праць. Ужгород: видавництво «Карпатська вежа», 2022. 192 с.